1962年、米ソ冷戦時代のアメリカで、政府の極秘研究所の清掃員として働く孤独なイライザ（サリー・ホーキンス）は、同僚のゼルダ（オクタヴィア・スペンサー）と共に秘密の実験を目撃する。アマゾンで崇められていたという、人間ではない“彼”の特異な姿に心…